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Una vez finalizado el tratamiento de las diarreas y colitis por antibióticos se detectan recurrencias en el 20% de los pacientes pasadas 1-3 semanas e incluso 2 meses. Los pacientes con colitis, diarrea grave o persistente pueden precisar tratamiento. En estos casos se repetirá el tratamiento con metronidazol 250-750mg/6h o vancomicina 125-500mg/6h (dosis correspondientes a la administración oral). Como medidas preventivas de recaidas debe evitarse la administración de antibióticos para tratar infecciones menores durante los 2 meses posteriores al tratamiento de diarreas y colitis. En aquellos pacientes que sufren recaídas múltiples podrían emplearse terapias alternativas o coadyuvantes al tratamiento convencional como administrar de forma intermitente metronidazol o vancomicina durante semanas, a dosis bajas, o bien, adicionar a la terapia tradicional enemas de vancomicina. También se ha empleado la colestiramina o el colestipol al finalizar el tratamiento antibiótico, así como rifampicina junto a vancomicina oral. Se ha estudiado el uso de Lactobacillus (cepa GC, 1g/6h, durante 3 semanas) mostrando resultados favorables en los casos no graves; es más racional que el uso de yogurt u otros lactobacilos. También se ha estudiado la administración oral de Saccharomyces boulardii (500mg/12h durante 1 mes) concluyendo que hay una reducción del 50% de las recaídas, iniciando el tratamiento 4 días antes de recibir antibiotiterapia de 10 días. Estos se asocian a metronidazol o vancomicina. Las terapias alternativas se emplean en casos refractarios o recurrentes aunque no sean suficientemente eficaces.
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